C'est principalement la racine du wasabi qui est consommée et cuisinée ; elle est assez courte et massive. Les tiges sont épaisses et la plante du wasabi se distingue par ses larges feuilles en forme de coeurs. Le rhizome de wasabi à une couleur vert pâle. Il est rare de trouver une racine fraîche, ce qui explique son prix souvent élevé.

Bien qu'il soit facile de trouver du wasabi en tube, rien n'égale la saveur du wasabi fraîchement râpé. Si vous recherchez la racine fraîche de wasabi, orientez votre choix sur une racine provenant de Shizuoka, la préfecture japonaise spécialiste en la matière.

La racine se râpe d'une manière bien précise pour en extraire tous les arômes. Une râpe en bois est recommandée ainsi qu'un mouvement du poignet spécifique. En effet, il ne s'agit pas de râper le wasabi comme une carotte, mais en suivant une sorte de rotation. Tournez la racine et dessinez de petits cercles sur la râpe en bois. Une petite quantité de wasabi suffit pour relever la saveur de vos plats et préparations.

Ce condiment possède une saveur forte qui a la particularité de monter au nez. La pâte de wasabi s'utilise en petite quantité avec les poissons crus comme les sushis, les sashimis, le saumon ou le thon.

Le wasabi peut également s'ajouter à une sauce ou à l'eau de cuisson pour la soupe miso, une fois râpé.

Il peut, enfin, aromatiser une mayonnaise ou une vinaigrette.

Le rhizome emballé se conserve au frais pendant une trentaine de jours.